Личинки яблонной плодожорки вредоносны. Сразу после вылупления они внедряются под кожицу плода. Они прокладывают в ней ходы в виде узких, дугообразных, изогнутых мин. Внутренняя часть повреждённых плодов чернеет и издаёт неприятный запах гнили. Они преждевременно опадают.